卵巢囊肿的引发原因较为复杂，目前认为可能与以下几方面因素有关。一般来说，卵巢囊肿的形成涉及多种因素综合作用。
内分泌因素
排卵相关： 卵巢是排卵、分泌性腺激素的重要器官，卵巢囊肿多发生于生育年龄。女性的排卵过程中，卵巢表面上皮细胞反复破损，可能与囊肿形成有关。据统计，未产妇或未育妇的卵巢囊肿发病率相对较高。激素失衡： 过多的促黄体生成素等激素失衡情况，可能会刺激卵巢组织增生，从而增加卵巢囊肿发生的风险。比如一些内分泌紊乱的女性，就更容易出现卵巢囊肿问题。
生活方式因素
不良饮食习惯： 长期的饮食结构不合理，高胆固醇饮食，而维生素A、C、E的缺乏，吸烟、饮酒等不良生活习惯，都可能影响卵巢的正常功能，增加卵巢囊肿的发生几率。比如长期大量吸烟的女性，卵巢功能受影响，患卵巢囊肿的风险相对会高一些。长期精神压力： 现代社会女性面临较大的精神压力，长期的精神紧张可导致机体免疫功能下降，内分泌失调，内环境发生改变，进而影响卵巢的正常排卵和组织代谢，容易促使卵巢囊肿的形成。
环境因素
环境污染： 食物中的激素残留，比如一些含有激素的家禽、蔬菜等，以及长期处于有工业污染的环境中，都可能对女性内分泌系统产生影响，增加卵巢囊肿发生的可能性。例如长期生活在工业废气排放较多区域的女性，卵巢囊肿的发病风险可能会有所升高。电离辐射等： 长期接触电离辐射等物理因素，也可能干扰卵巢的正常生理功能，与卵巢囊肿的发生存在一定关联。不过这种情况相对较少见，但也是需要关注的环境影响因素之一。
遗传因素
家族遗传倾向： 据研究，约20% - 25%的卵巢囊肿患者有家族遗传史。如果家族中有亲属患有卵巢囊肿，那么个体携带相关遗传基因的概率会增加，相对更容易患上卵巢囊肿。比如母亲或姐妹患有卵巢囊肿，自身患病风险就比一般人要高一些。