卵巢囊肿的引发原因较多，其中生理性因素较为常见，比如女性在月经周期中，黄体形成过程中可能形成黄体囊肿，这种情况通常会在月经结束后自然消失，约有10%左右的女性会出现这类生理性卵巢囊肿。
一、内分泌因素
激素失衡影响： 卵巢是产生卵子并分泌激素的重要器官，当体内激素水平失衡时易引发卵巢囊肿。比如雌激素水平过高，可能刺激卵巢组织过度增生，从而形成囊肿。像一些长期服用激素类药物的女性，就更容易出现这种激素失衡导致囊肿的情况。促性腺激素异常： 垂体分泌的促性腺激素如果出现异常，也会干扰卵巢的正常功能。例如促卵泡生成素等分泌失调，会影响卵巢的排卵以及内部组织的代谢，进而促使卵巢囊肿形成。
二、生活方式因素
不良饮食习惯： 长期饮食结构不合理，高胆固醇、高油腻食物摄入过多，而蔬菜水果摄入不足，会影响身体的新陈代谢，增加卵巢囊肿的发病风险。有研究发现，这类不良饮食习惯的人群中，约15%左右可能会患上卵巢囊肿。长期精神压力大： 现代社会中，女性面临工作、生活等多方面压力，如果长期处于精神紧张状态，会影响下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴的调节功能，导致内分泌紊乱，增加卵巢囊肿的发生几率。
三、环境因素
环境污染影响： 长期处于被污染的环境中，比如接触工业污染物、农药残留等，这些环境中的有害物质可能会通过各种途径影响女性的生殖系统，干扰卵巢的正常生理功能，从而引发卵巢囊肿。据统计，生活在污染较严重地区的女性，卵巢囊肿的发病率比污染较轻地区的女性高出约10%。饮食中的环境激素： 一些食物中可能含有环境激素，比如某些家禽饲养过程中使用的促生长激素等，长期食用含有这类环境激素的食物，也可能影响女性内分泌，促使卵巢囊肿形成。