小孩抽动症的病因目前尚未完全明确，可能与多种因素相关。一般认为遗传因素是一个重要方面，约50% - 60%的抽动症患儿有家族史，亲属中患抽动障碍及其他精神神经疾病的概率更高。
遗传因素影响
家族遗传倾向： 研究发现，如果家族中有成员患有抽动症等相关神经精神类疾病，那么小孩患抽动症的风险会明显增加。比如有血缘关系的亲属中有人确诊，小孩发病几率比普通人群高不少。基因层面关联： 目前已经发现一些与抽动症相关的基因位点，虽然具体机制还在深入研究中，但基因遗传在抽动症的发病里起到了基础性作用。
神经生物学因素
神经递质失衡： 大脑中的多巴胺、去甲肾上腺素等神经递质失衡可能引发抽动症。例如多巴胺代谢异常，会影响神经信号的传递，从而导致肌肉不自主抽动。正常情况下神经递质处于平衡状态来调控身体运动等功能，一旦失衡就容易出现抽动症状。大脑结构异常： 部分抽动症患儿的大脑基底节等区域存在结构上的异常，像体积改变等情况。这些结构上的变化会影响大脑正常的功能调控，进而引发抽动症状。
心理社会因素
家庭环境影响： 家庭氛围紧张、父母关系不和谐、过度溺爱或苛求等不良家庭环境，可能会让小孩心理压力增大，从而诱发或加重抽动症。比如长期生活在父母经常争吵的家庭里，小孩更容易出现情绪问题，进而引发抽动症状。心理应激事件： 突然遭遇重大生活事件，如亲人离世、家庭搬迁、学业压力过大等心理应激情况，也可能促使小孩患上抽动症。例如有的小孩在经历父母离异后，很快出现了抽动症状。