小孩抽动症的病因目前还不完全明确，可能与多种因素有关。一般认为遗传因素是一个重要方面，有研究显示约50% - 60%的抽动症患儿有家族遗传史，若家族中有亲属患抽动症，孩子患病风险相对较高。
神经生物学因素
大脑神经递质失衡： 体内多巴胺、去甲肾上腺素、5 - 羟色胺等神经递质的失衡可能与抽动症相关。比如多巴胺功能亢进，就可能导致肌肉不自主抽动等症状出现。大脑结构异常： 部分患儿大脑中的基底节等部位存在结构上的微小异常，影响了神经信号的正常传递，从而引发抽动症相关表现。
心理因素
精神压力过大： 当小孩长期处于较大的精神压力下，像学习压力过重、家庭环境不和谐等情况，都可能诱发或加重抽动症。例如有的孩子因为考试成绩不理想，长期处于紧张焦虑状态，之后出现抽动症状。情绪应激： 突然的情绪刺激，如受到惊吓、过度兴奋等，也可能成为抽动症发作的诱因。比如孩子观看了恐怖电影后，可能会出现抽动症状的短暂加重。
环境因素
感染因素： 某些病毒感染可能会影响神经系统，进而引发抽动症。例如链球菌感染后，可能会引发自身免疫反应，波及神经系统，导致抽动症发生。中毒因素： 长期接触某些有毒物质，如铅等重金属中毒，也可能增加小孩患抽动症的几率。如果孩子生活在铅污染较严重的环境中，就需要警惕抽动症的发生。