三个月没来月经，原因可能包括正常情况、月经失调以及怀孕。
一、正常情况。在青春期、更年期、哺乳期等特殊时期，由于生理性的卵巢内分泌功能低下或者紊乱，就容易出现月经推迟现象，有可能长达三个月不来月经，这属于正常情况。比如青春期时，女性身体还在发育完善中，卵巢功能尚不稳定，可能会导致月经周期不规律；更年期女性体内激素水平波动较大，也会影响月经；哺乳期女性因泌乳素分泌较多等，也可能引起月经的异常。
二、月经失调。若并非处于上述特殊时期，那么三个月不来月经则很可能是月经失调所致。像情绪紧张、焦虑，经常熬夜，饮食不当等，都有可能引发这种状况。例如情绪过度紧张焦虑会影响下丘脑-垂体-卵巢轴的功能，进而干扰月经；长期熬夜会打乱人体生物钟，影响内分泌系统，导致月经失调；饮食不规律或过度节食等也可能对月经产生不利影响。
三、怀孕。当有性生活时，出现三个月不来月经的情况就要考虑怀孕的可能性。可以通过去医院化验或者做B超来准确判断是否怀孕。比如医院化验血液中的人绒毛膜促性腺激素水平，若升高明显则提示怀孕；B超检查可以直观看到宫腔内是否有孕囊等情况来判断是否怀孕。
总之，三个月不来月经可能有多种原因，需要根据具体情况进行分析和判断，必要时采取相应的检查和措施。