3个月没来月经可能由多种原因引起。首先要考虑怀孕，对于有性生活的女性，怀孕是常见原因，可通过验孕棒检测或到医院查血HCG来明确是否妊娠。
内分泌失调因素
多囊卵巢综合征：这是常见的内分泌疾病，约占无排卵性不孕的70%。患者体内雄激素水平升高，会出现月经稀发甚至闭经情况，还常伴有多毛、痤疮、肥胖等表现。甲状腺功能异常：甲状腺功能减退时，甲状腺激素分泌不足，会影响下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴的功能，导致月经紊乱，包括月经推迟甚至闭经，同时可能伴有畏寒、乏力、水肿等症状；而甲状腺功能亢进时，也可能出现月经周期改变。
生活方式因素
过度节食：如果女性为了减肥过度节食，摄入热量不足，身体会处于饥饿状态，导致体内脂肪含量过低，影响雌激素的正常合成，从而引起月经失调，出现3个月不来月经的情况。一般体重过低会使体内脂肪量低于维持正常月经周期的最低需求。长期熬夜：长期熬夜会打乱人体的生物钟，影响内分泌系统的正常功能，下丘脑 - 垂体分泌激素的节律被打破，进而影响月经周期，导致月经推迟甚至闭经。长期熬夜的女性往往内分泌紊乱的概率比作息规律的女性高很多。
疾病因素
卵巢功能衰退：常见于40岁以上女性，随着年龄增长，卵巢功能逐渐衰退，雌激素分泌减少，会出现月经周期延长、经量减少，直至闭经。一般40岁以后卵巢功能开始有明显下降趋势。宫腔粘连：多因人工流产、刮宫等宫腔操作损伤子宫内膜引起。宫腔粘连会导致宫腔部分或完全闭塞，影响月经血的排出，从而出现月经推迟甚至闭经，同时可能伴有周期性下腹痛。有过多次宫腔操作史的女性发生宫腔粘连的风险较高。