直肠镜与结肠镜是有区别的。一般来说，直肠镜检查通常只能观察直肠部位，检查长度较短，一般在25厘米左右；而结肠镜检查能观察从肛门到回盲瓣的全部大肠黏膜，检查长度可达150厘米左右。
检查部位差异：
直肠镜：主要针对直肠进行检查。它能清晰看到直肠的黏膜状况，比如直肠是否有炎症、溃疡、息肉等病变。检查时患者多采取左侧卧位，医生将直肠镜缓慢插入直肠进行观察。结肠镜：可检查从直肠开始，依次经过乙状结肠、降结肠、横结肠、升结肠，最终到达回盲部的整个结肠部位。能更全面地查看肠道内的病变情况，像结肠息肉、结肠炎、结肠癌等都能通过结肠镜发现。
检查前准备不同：
直肠镜：检查前准备相对简单，一般需要清洁肠道，通常服用少量的泻药清理直肠部位即可。比如检查前1 - 2小时口服适量的泻药，将直肠内的粪便排净，保证视野清晰。结肠镜：检查前准备较为复杂。需要提前1 - 2天开始进食少渣饮食，检查前1天晚上要服用较大剂量的泻药，如聚乙二醇电解质散等，将肠道内的粪便完全排净，直到排出物为清水样便，这样才能保证结肠镜能顺利进入并清晰观察肠道黏膜。
适用情况有别：
直肠镜：适用于怀疑直肠有病变的情况，比如患者出现直肠部位的便血、排便习惯改变等症状时，首先会考虑做直肠镜检查。另外，一些直肠疾病的初步筛查也常选用直肠镜。结肠镜：适用于多种情况，像出现不明原因的腹痛、腹泻、便血，怀疑肠道有病变时；或者是结肠息肉术后复查；还有家族中有结肠癌病史，需要进行结肠筛查等情况，都会选择结肠镜检查。比如40岁以上人群，即便没有明显症状，也可以考虑定期做结肠镜筛查结肠癌等疾病。