睡醒后眼睛肿了可通过以下方式治疗：
一、药物
1.若为炎症引起，可遵医嘱使用更昔洛韦滴眼液、左氧氟沙星滴眼液、伐昔洛韦滴眼液等药物进行治疗，还可在医生指导下口服阿莫西林、阿奇霉素等抗生素以有效治疗。
2.对于病毒感染导致的，可使用抗病毒滴眼液等。
二、冷敷
睡醒后眼睛肿了的患者可采用冷敷的方式，能抑制局部神经，促使肿胀快速消退，同时可缓解眼睛疼痛症状。
三、手术
如果是麦粒肿引起的眼睛肿，且使用上述方法效果不佳时，患者还可采取手术方式进行治疗。
此外，患者在治疗期间应注意饮食清淡，避免食用辛辣刺激性食物，以免病情持续加重。
总之，针对睡醒后眼睛肿的情况，可根据具体病因选择合适的治疗方法，同时注意相关的饮食禁忌。