干燥综合症是一种自身免疫性疾病，目前其具体发病原因尚未完全明确，但可能与以下几方面因素有关。目前研究发现，遗传因素在干燥综合症的发病中起到一定作用，有研究显示约10%的干燥综合症患者有家族遗传倾向。
遗传因素相关
基因易感性： 某些基因的突变或变异可能增加患干燥综合症的风险。例如，人类白细胞抗原（HLA）系统中的一些基因位点与干燥综合症的发病相关，像HLA - DR3、HLA - DR4等基因亚型在干燥综合症患者中的携带频率可能高于正常人群。家族聚集性： 如果家族中有亲属患有干燥综合症，那么其他家庭成员患该病的几率相对普通人群会有所升高。不过，即使有家族遗传倾向，也不是一定会发病，只是患病风险相对增加。
免疫因素影响
免疫系统异常激活： 患者的免疫系统会错误地攻击自身的外分泌腺体，尤其是唾液腺和泪腺。正常情况下，免疫系统能够识别自身和非自身物质并进行正确的免疫应答，但在干燥综合症患者体内，免疫系统的B淋巴细胞过度活化，产生大量自身抗体，如抗核抗体、抗SSA抗体、抗SSB抗体等。这些自身抗体与体内的相应抗原结合，形成免疫复合物，沉积在唾液腺、泪腺等外分泌腺体组织中，引发炎症反应，导致腺体结构破坏，功能受损，出现口干、眼干等干燥综合症的典型症状。细胞免疫异常： T淋巴细胞在免疫反应中也发挥着重要作用，干燥综合症患者体内的T淋巴细胞亚群失衡，可能影响了免疫调节功能，进一步加剧了对自身腺体的免疫损伤。
病毒感染关联
病毒感染可能诱发： 有研究推测某些病毒感染可能是触发干燥综合症的诱因之一。例如，EB病毒、丙型肝炎病毒等。EB病毒感染可能会改变人体的免疫状态，使得免疫系统对自身组织的耐受性降低，从而引发自身免疫反应导致干燥综合症。丙型肝炎病毒感染也与一些自身免疫性疾病相关，有部分干燥综合症患者同时合并丙型肝炎病毒感染，提示病毒感染可能在干燥综合症的发病过程中起到了一定的触发作用，但具体的作用机制还需要进一步深入研究来明确。