药流即药物流产，药物流产排出孕囊后肚子疼可能存在两种情况，一是正常现象，二是继发感染。以下是具体内容：
一、正常现象
女性进行药物流产排出孕囊后，子宫会持续收缩以推动残留蜕膜组织和子宫内积血的排出。在此过程中，因子宫的持续收缩，患者会感觉到疼痛。若疼痛持续时间较短，通常属于正常情况，无需特殊处理。可采取如下措施来缓解：
1.利用暖宝宝、热水袋等物品热敷腹部。
2.多喝温水。
3.适当下床活动，以促进组织物的排出。
二、继发感染
女性在药物流产后身体较为虚弱，抵抗力下降，容易遭受病原菌侵袭，或者在药物流产过程中未注重会阴部卫生，就可能继发细菌感染，引发妇科炎症。由于炎症因子的刺激，也会出现肚子疼的症状。可在医生指导下使用如下药物进行治疗：
1.头孢呋辛酯片。
2.康妇炎胶囊。
3.金刚藤胶囊。若感染是由子宫腔残留组织导致，则需要进行清宫手术治疗。在治疗期间要注意多休息，避免剧烈运动。饮食上可多进食新鲜蔬菜、水果、牛奶等营养丰富的食物以助力恢复。
总之，药物流产排出孕囊后肚子疼需要根据具体情况来判断和处理，要在医生的指导下进行相应的应对措施，以保障身体的健康恢复。