药流后肚子疼可能由子宫收缩或宫内感染引起。
一、子宫收缩：药物流产后，宫腔内若有残留妊娠产物会引发子宫收缩。子宫收缩会带来相应反应，比如肚子疼。这种疼痛通常持续较久且症状严重。此时需前往医院进行彩超检查以了解宫内状况。若残留物较多且无法排净，则可能需要进行清宫处理。
二、宫内感染：药物流产流血时间长，在阴道流血时，宫口处于开放状态，开放的宫颈口易导致病原菌入侵，从而引发宫内感染并导致肚子疼。这时需要使用抗生素进行消炎治疗，比如使用头孢类消炎药。
当药流后出现肚子痛时，应及时前往正规医院妇科进行抽血或B超检查，以明确病情，并在医生指导下进行治疗。同时，药流后要注意私处卫生，恢复期间避免性生活，注意勤换洗内裤，洗完后需在阳光下暴晒消毒。
总之，药流后肚子疼要重视，需及时检查明确原因并采取相应措施，同时做好相关护理。