宫颈囊肿主要是由于宫颈腺管口狭窄或阻塞导致腺体分泌物引流受阻、潴留形成的。一般来说，它是一种常见的妇科良性病变。
宫颈腺管口阻塞因素
生理性变化导致： 女性在青春期后，宫颈鳞状上皮和柱状上皮会发生移位，在鳞状上皮取代柱状上皮的过程中，新生的鳞状上皮覆盖宫颈腺管口或伸入腺管，可将腺管口阻塞，导致腺体分泌物引流受阻，潴留形成囊肿。这种情况比较常见，通常没有明显症状。慢性炎症影响： 长期的慢性宫颈炎，如宫颈糜烂、宫颈肥大等炎症刺激，会使宫颈组织反复发生充血、水肿，炎性细胞浸润及结缔组织增生，进而导致宫颈腺管口狭窄，引发囊肿。比如有慢性宫颈炎病史的女性，相对更容易出现宫颈囊肿。
其他相关因素
损伤引发： 分娩、流产、宫腔操作等使宫颈受到损伤，也可能导致宫颈腺管口阻塞，从而形成宫颈囊肿。例如，进行过人工流产手术的女性，宫颈受到一定程度的损伤，就存在宫颈囊肿发生的风险。个体差异： 不同女性的宫颈局部环境等存在个体差异，一些女性可能自身宫颈腺管的结构等因素更容易出现阻塞情况，进而形成宫颈囊肿。比如有的女性宫颈腺管天生相对狭窄，就比其他人更易发生宫颈囊肿相关情况。