扁桃体结石可以通过一些方法去除，比如较小的结石可以尝试用盐水漱口来清理。一般来说，每次用温盐水（大约半杯温水加半茶匙盐）漱口，每天漱口几次，有可能将较小的扁桃体结石冲出来。
自行清理方法
使用棉签轻轻擦拭：如果能看到比较小的扁桃体结石，在保证卫生的情况下，可以用干净的棉签轻轻尝试擦拭，但要注意力度，避免损伤扁桃体。不过这种方法对于较深部位的结石效果不佳。含漱盐水：除了上面提到的用温盐水漱口，还可以使用专门的含漱液，按照说明使用，也有助于减少扁桃体结石产生的几率以及可能清理掉较小的结石。一般含漱液每天使用2 - 3次比较合适。
医疗专业处理方式
医生用器械取出：如果扁桃体结石较大或者自己无法清理，需要就医，医生会使用特殊的器械，如钳子等将结石取出。这种方法需要在医院由专业医生操作，相对比较安全，但也需要患者配合张开嘴巴等操作。激光治疗：对于反复出现扁桃体结石的情况，有些医生可能会采用激光治疗的方法。激光可以破坏扁桃体隐窝，减少结石形成的环境，但这种方法相对应用范围较窄，一般是在其他方法效果不佳时考虑。
日常预防与注意事项
保持口腔清洁：每天至少刷牙两次，每次刷牙时间不少于3分钟，同时要注意清洁舌苔等部位。另外，使用牙线也能帮助保持口腔卫生，减少食物残渣在口腔内残留，从而降低扁桃体结石形成的可能性。增强免疫力：通过合理饮食、适量运动等方式增强免疫力。比如饮食上多吃富含维生素的蔬菜水果，像橙子、西兰花等，每周进行至少150分钟的中等强度运动，如快走等，有助于身体维持良好的状态，减少扁桃体相关问题的发生。