一般来说，当患者出现小便疼痛且有脓液流出的情况时，常常考虑是由淋菌性尿道炎所导致。对于淋菌性尿道炎，可以采用如下方法进行治疗。
一、治疗方法
1.一般治疗：患者应适度休息，避免进食生冷及刺激性食物。每日清洗尿路部位，并保持其干燥。在治疗期间应尽可能避免性接触，以防出现交叉感染。
2.药物治疗：患者必须在医生的指导下用药，切不可自行用药。常用的药物包括四环素、阿奇霉素、左氧氟沙星、环丙沙星、甲硝唑等。
二、病因
1.致病菌：主要的致病菌为淋球菌，其能侵入男性前尿道以及女性尿道，并借助表面的菌毛黏附在尿道细胞的表面。
2.诱发因素：不洁的性生活、自身免疫力低下、外伤感染等都可能引发淋菌性尿道炎。
需要注意的是，小便疼痛且有脓液流出还可能存在其他原因，所以建议患者及时前往医院就诊，完善相关检查以明确病因，进而给予有针对性的处理或治疗。
总结：本文主要阐述了小便疼痛且有脓液流出可能是淋菌性尿道炎引起，介绍了其治疗方法包括一般治疗和药物治疗，还说明了病因有致病菌和诱发因素，同时强调出现这种情况应及时就医明确原因并治疗。