外耳道疖肿主要是由细菌感染引起的，金黄色葡萄球菌是最常见的致病菌，约占90%。
局部因素导致
挖耳损伤：经常用指甲、发卡等挖耳，很容易造成外耳道皮肤损伤，细菌就容易趁机侵入引发疖肿。比如有些人没事就喜欢频繁挖耳，这样就大大增加了患外耳道疖肿的风险。外耳道环境潮湿：游泳、洗澡后外耳道积水，或者长期处于高温、高湿度环境中，会使外耳道皮肤的局部抵抗力下降，有利于细菌滋生繁殖，从而诱发外耳道疖肿。像长期在潮湿环境工作的人，就比较容易出现这种情况。
全身因素影响
抵抗力低下：当人体抵抗力降低时，比如患有糖尿病、慢性肾炎等慢性疾病，或者长期疲劳、睡眠不足等，身体抵御细菌的能力减弱，就容易受到金黄色葡萄球菌等病菌的侵袭，引发外耳道疖肿。例如糖尿病患者由于血糖控制不佳，机体免疫力下降，更容易发生外耳道疖肿。全身性疾病：一些全身性疾病会影响外耳道皮肤的健康，促使疖肿形成。除了糖尿病外，像营养不良、贫血等疾病，也会导致身体免疫力下降，增加外耳道疖肿的发病几率。比如长期营养不良的人，身体各项机能都受到影响，外耳道皮肤的防御功能也会变差。