慢性肠炎可以根治，而根治用药取决于病因。明确病因后用药才能彻底根治慢性肠炎。
一、引起肠炎的原因主要是感染，具体包括以下几方面：
1.真菌感染：这是导致肠炎的原因之一，此时需要吃两性霉素或制菌霉素等药物来进行根治。
2.细菌感染：这是较为常见的肠炎感染类型，一般吃头孢拉定、红霉素、庆大霉素等药物就能够根除细菌。
3.寄生虫感染：有少部分人患慢性肠炎是因为寄生虫感染，那么就需要针对性地杀灭寄生虫，比如可以吃吡喹酮等药物来达到根治肠炎的目的。
二、慢性肠炎作为常见的慢性炎症，是能够实现根治效果的，但用药必须依据病因。不同感染所引发的肠炎，用药存在着差异。
所以，慢性肠炎确实是可以根治的，用何种药能根治需依据病因来确定，并非指定某一种药就能根治肠炎，只有找准病因后对症用药才能取得最佳的根治效果。