3岁孩子长期便秘，其原因主要包括长时间不运动、饮食不当、直肠炎等，此外还可能是肠易激综合征、先天性巨结肠、幽门梗阻、肠梗阻等原因引起。具体如下：
一、长时间不运动：如果孩子长时间卧床或运动量过少，就可能导致胃肠道蠕动变缓，从而出现大便次数明显减少的情况。对此，可以适当让孩子进行运动，比如散步、慢跑等，这样有助于排便。
二、饮食不当：孩子胃肠功能相对较弱，要是经常食用油腻食物，例如炸鱼、炸肉等，很可能引发消化不良，进而出现早饱、腹胀以及便秘等一系列症状。这种情况下可以遵循医嘱口服复方消化酶胶囊、双歧杆菌三联活菌散、双歧杆菌四联活菌片等药物来进行治疗，同时还可以采用推拿、按摩等方式来促进消化。
三、直肠炎：孩子若经常吮吸手指，就容易感染细菌而引发炎症，可能会损伤直肠黏膜，导致出现直肠不适、排便费力等状况。此时可以依照医嘱口服头孢克肟颗粒、青霉素V钾片、头孢呋辛酯片等药物以减轻炎症。平时要格外注意孩子的个人卫生，避免其吮吸手指。
总之，3岁孩子长期便秘的原因多样，需要到消化内科就诊，明确具体病因后再进行针对性治疗。