表皮囊肿的治疗方式需根据具体情况选择，一般较小且无症状的表皮囊肿可密切观察，而较大或有症状的通常需要手术切除。手术切除是治疗表皮囊肿较为有效的方法，完整切除后复发几率相对较低。
手术治疗情况
小囊肿切除：对于直径较小（通常小于1 - 2厘米左右）、位置表浅且没有明显不适症状的表皮囊肿，可在局部麻醉下进行手术切除。手术操作相对简单，切口较小，术后恢复较快。大囊肿或特殊部位切除：如果表皮囊肿较大，或者生长在一些特殊部位（如面部等影响美观的部位，或深部组织内的囊肿），可能需要在局部浸润麻醉或全身麻醉下进行切除。手术中需要完整剥离囊肿，避免囊肿破裂导致复发。
非手术治疗注意事项
观察随访：对于一些非常小的、没有任何症状的表皮囊肿，医生可能会建议定期观察随访。比如直径在0.5厘米以下，而且没有红肿、疼痛等表现的表皮囊肿，可以每隔3 - 6个月到医院进行复查，观察囊肿的大小、形态等是否有变化。但如果在观察过程中发现囊肿有增大、出现疼痛、红肿等情况，就需要考虑手术治疗。避免刺激：在观察期间，要注意避免对囊肿部位进行挤压、摩擦等刺激，因为过度刺激可能会引起囊肿感染等情况，增加后续治疗的难度。
术后护理要点
伤口护理：如果进行了手术切除，术后要注意伤口的护理。保持伤口清洁干燥，按照医生的要求定期换药。一般术后1 - 2天需要更换一次敷料，观察伤口有无渗血、渗液、红肿等情况。如果是头部等毛发较多部位的手术切口，要注意保持切口周围头皮的清洁，防止切口感染。休息与饮食：术后患者需要适当休息，避免剧烈运动。在饮食方面，要注意加强营养，多吃富含蛋白质、维生素的食物，如瘦肉、鸡蛋、新鲜蔬菜水果等，有助于伤口的愈合。同时要避免食用辛辣、刺激性食物以及海鲜等容易引起过敏的食物，以免影响伤口恢复或引起过敏反应。