三个月大的宝宝晚上睡觉哭闹，可能有以下原因：
1.生理需求：宝宝可能因为饥饿、口渴、尿布湿了或需要换尿布而哭闹。
2.环境因素：宝宝的房间温度过高或过低、环境嘈杂、光线过强等都可能影响睡眠。
3.身体不适：宝宝可能因为感冒、鼻塞、腹胀、腹痛等身体不适而哭闹。
4.缺乏安全感：宝宝可能需要更多的安抚和陪伴，可以尝试抱抱、拍拍、摇摇等方式让宝宝感到安全。
5.睡眠习惯：宝宝可能还没有建立良好的睡眠习惯，需要逐渐培养。
针对以上原因，可以采取以下措施：
1.确保宝宝的基本需求得到满足，如饥饿、口渴、尿布湿了等。
2.调整宝宝的房间环境，保持适宜的温度、湿度和光线。
3.注意观察宝宝的身体状况，如有不适及时就医。
4.给宝宝足够的安抚和陪伴，让宝宝感到安全。
5.逐渐培养宝宝的睡眠习惯，如固定的睡眠时间、睡前仪式等。
如果宝宝哭闹持续时间较长或伴有其他异常症状，建议及时就医，以便确定具体原因并采取相应的治疗措施。