慢性胃肠炎的治疗药物需根据具体症状选择，一般可使用抑制胃酸分泌药、胃黏膜保护剂等。例如，质子泵抑制剂如奥美拉唑，能有效抑制胃酸分泌，通常一天服用1 - 2次来缓解胃酸过多引起的不适。
抑制胃酸分泌类药物
质子泵抑制剂： 像奥美拉唑、兰索拉唑等都属于这类药物。它们能强力抑制胃酸分泌，对于慢性胃肠炎伴有胃酸过多、烧心等症状的患者有较好的缓解作用。比如奥美拉唑，通过特异性地抑制胃壁细胞H⁺-K⁺-ATP酶的活性，从而阻断胃酸分泌的最后步骤。H₂受体拮抗剂： 常见的有雷尼替丁、法莫替丁等。这类药物通过竞争抑制组胺H₂受体，减少胃酸分泌。一般来说，雷尼替丁口服后，能在一定时间内持续发挥抑制胃酸的效果，可用于缓解慢性胃肠炎相关的胃酸过多症状。
胃黏膜保护剂
铝碳酸镁： 它可以中和胃酸，还能在胃黏膜表面形成一层保护屏障，防止胃酸、胆汁等对胃黏膜的进一步损伤。例如，当慢性胃肠炎患者出现胃痛、胃灼热等症状时，服用铝碳酸镁能快速缓解不适，并且在胃内形成的保护屏障可以持续一段时间，帮助受损的胃黏膜修复。枸橼酸铋钾： 服用后在胃内酸性环境中形成弥散性的保护层覆盖于溃疡面上，促进溃疡黏膜再生和溃疡愈合。它还能杀灭幽门螺杆菌，对于伴有幽门螺杆菌感染的慢性胃肠炎患者有一定的辅助治疗作用。
调节胃肠动力类药物
多潘立酮： 能促进胃肠道蠕动，加快胃排空，缓解慢性胃肠炎患者出现的腹胀、恶心、呕吐等症状。一般在饭前15 - 30分钟服用，可改善胃肠动力不足引起的不适情况。莫沙必利： 同样是促进胃肠动力的药物，它可以刺激肠道胆碱能中间神经元及肌间神经丛的5 - HT₄受体，促进乙酰胆碱的释放，从而增强胃肠道运动，改善慢性胃肠炎患者的消化不良等症状。不过，使用这类药物时，需要注意遵循医生的建议，根据病情合理用药。