巧克力囊肿患者有怀上孩子的可能。如果女性的卵巢巧克力囊肿较小（小于2厘米以下）且患者较为年轻，同时卵巢功能良好，那么是有怀孕几率的。然而，若卵巢巧克力囊肿较大（超过5厘米），已经对卵巢内分泌功能产生影响，造成内分泌失调，并且患者年龄较大（超过35岁），则怀孕的概率会比较小。
巧克力囊肿的成因包括：
一、先天性因素。由于胚胎发育异常，导致子宫颈口狭窄或先天性子宫口闭锁，致使经血排出不畅，从而形成巧克力囊肿。
二、输卵管堵塞。这是引发巧克力囊肿的一个极为重要的原因。每个月女性的受精卵泡都会变成废弃物需要排出，但如果存在输卵管堵塞，那么卵巢内的一些废物就无法顺利排出，积压在体内进而形成巧克力囊肿。
三、性生活频繁。一些剧烈的机械性运动容易引发阴道胀裂，过于频繁的性生活易导致阴道破损，这会给阴道带来困扰，长此以往容易引发妇科疾病，巧克力囊肿较为常见。
四、盆腔炎症。盆腔有炎症时会有大量陈旧淤血，这些淤血不能及时排出，在月经期会与子宫内膜一起代谢，阻碍子宫内膜的正常代谢，容易形成巧克力囊肿。
五、分娩多次流产。巧克力囊肿的发病原因是女性在月经期间子宫内膜碎片不能正常消除，而分娩、多次人工流产或在月经期间有性生活等都可能导致巧克力囊肿。
针对巧克力囊肿的解决办法如下：
一、饮食方面。要减少食用含雌激素的食物，不要吃过于油腻的食物，避免食用霉变、腌制食品。
二、生活方面。在日常生活中要注重个人卫生，勤换内衣，定期用温水清洗阴部。
三、药物方面。可以使用地诺孕素等。但上述药物需在医生指导下，根据患者病情选择合适的剂量和疗程，不可盲目自行服用。
总之，巧克力囊肿患者能否怀孕需视具体情况而定，其成因多样，解决办法也包含多个方面，应根据实际情况进行针对性处理。