巧克力囊肿患者有怀孕的可能，但怀孕难度会增大，甚至可能引发不孕。巧克力囊肿一般指的是卵巢异位囊肿，也就是子宫内膜异位到卵巢部位所形成的囊肿，其对怀孕会有一定影响。
一、如果卵巢巧克力囊肿体积较小，能够正常排卵，且月经周期规律，通常是可以怀孕的。但怀孕后需要定期进行产检以了解胚胎发育状况，要高度警惕出现先兆流产、稽留流产等情况。
二、卵巢巧克力囊肿往往会使怀孕难度增加，即受孕困难，严重情况下甚至会导致不孕，其不孕率通常高达40%。而卵巢巧克力囊肿引起不孕主要与以下方面密切相关：
1.盆腔微循环发生改变，影响到精子与卵子的结合以及运送。
2.免疫功能异常，导致抗子宫内膜抗体增加。
3.还可能会使卵巢功能出现异常，从而导致排卵障碍和黄体形成不良。
总之，巧克力囊肿对怀孕有影响，需要密切关注相关情况并采取相应措施。