先天性大脑发育不全是一种较为复杂的神经系统疾病，其症状表现多样。一般来说，患儿可能在运动、智力、语言等方面出现异常。例如，在运动方面，可能会存在运动发育迟缓，如抬头、坐、爬、站、走等大运动的发育明显落后于同龄儿童；在智力方面，可能会出现认知能力低下，学习困难等情况。
运动功能方面的症状
大运动发育迟缓： 先天性大脑发育不全的孩子往往大运动发育比正常孩子晚很多。正常婴儿3个月左右能抬头，4 - 7个月会坐，8 - 9个月能爬，1岁左右会走，但大脑发育不全的孩子可能到了相应月龄还不能完成这些动作。比如，18个月大的孩子还不能独站，24个月大的孩子还不能独走等。精细运动障碍： 精细运动也会受到影响，表现为拿东西不稳、抓握能力差等。正常婴儿7 - 9个月时能用拇指和食指捏取小物体，而大脑发育不全的孩子可能到了相应年龄还不能很好地完成捏取动作。
智力与认知方面的症状
智力低下： 患儿智力水平明显低于正常儿童。在认知能力上，对周围事物的认识、理解和反应都比较迟缓。例如，正常幼儿2 - 3岁能认识常见的物品和颜色等，而大脑发育不全的孩子可能到了这个年龄阶段还不能很好地认知。注意力不集中： 这类孩子往往很难集中注意力，对周围的事物关注度低，容易分心，学习新知识和技能的能力也相对较弱。
语言功能方面的症状
语言发育迟缓： 语言发育明显落后于正常儿童。正常婴儿1岁左右会叫爸爸、妈妈等简单称呼，1.5 - 2岁能说简单的句子，但大脑发育不全的孩子可能到了相应年龄还不能说出完整的句子，或者发音不清等。理解能力差： 对别人的语言指令理解困难，比如让其做某个动作，不能很好地理解指令并执行。
其他可能出现的症状
姿势异常： 还可能出现异常的姿势，如身体僵硬、四肢发软、角弓反张等异常的肢体姿势，这是由于大脑发育异常影响了肌肉的控制和协调所致。癫痫发作： 部分先天性大脑发育不全的孩子可能会出现癫痫发作，表现为突然的抽搐、意识丧失等症状，这是因为大脑神经元异常放电引起的。