肢端肥大症主要通过手术、药物和放射治疗来控制。手术方面，经蝶窦微创手术是常用方法，约60%~90%的患者通过手术可使生长激素（GH）水平恢复正常，但术后可能需要后续治疗。
手术治疗
经蝶窦微创手术： 这是首选的治疗方法，通过鼻腔进入蝶窦切除垂体瘤。该手术创伤小，术后恢复相对较快。不过，约有10%~30%的患者可能术后复发，需要进一步治疗。
药物治疗
生长抑素类似物： 如奥曲肽、兰瑞肽等。这类药物能抑制生长激素的分泌，一般需要长期使用。使用后约70%的患者GH水平可降低至正常范围，但可能会有注射部位疼痛、胃肠道不适等副作用。多巴胺受体激动剂： 像溴隐亭，部分患者使用后也能改善症状，但效果相对生长抑素类似物稍弱，约30%~40%的患者GH水平能得到控制。
放射治疗
外照射放疗： 包括传统的光子放疗等。一般在手术和药物治疗效果不佳时采用，放疗后GH水平通常需要数年才逐渐下降，约30%~60%的患者在放疗后GH能达到正常，但可能会出现垂体功能减退等远期并发症，如甲状腺功能减退、肾上腺皮质功能减退等。立体定向放射外科： 如伽马刀、质子刀等。相较于外照射放疗，其对周围正常组织的损伤相对较小，但费用较高，同样需要较长时间观察GH水平的变化。