一般来说，男性生殖器上长小痘痘的处理方式需先明确病因再行动。其可能是生殖器疱疹导致，主要呈现为生殖器有水泡、糜烂等情况。对此可在医生指导下用阿昔洛韦片或盐酸伐昔洛韦片等药物治疗。也可能是尖锐湿疣引发，主要表现有疼痛、瘙痒、异物感，质地柔软等，能在医生指导下服用泛昔洛韦片或阿昔洛韦片等进行医治。患者在患病期间一定要重视个人卫生，自己的私人用品也需和家里人分开使用，以防传染。
一、病因分析：
1.生殖器疱疹：
表现：生殖器出现水泡、糜烂等症状。
2.尖锐湿疣：
表现：疼痛、瘙痒、异物感，质地柔软等。
二、治疗方法：
1.生殖器疱疹：
(1)药物：可在医生指导下服用阿昔洛韦片或盐酸伐昔洛韦片等。
2.尖锐湿疣：
(1)药物：在医生指导下服用泛昔洛韦片或阿昔洛韦片等。
三、注意事项：
患者在患病期间一定要做好个人卫生，私人用品要和家里人分开使用，避免将疾病传染给他人。
总之，男性生殖器上长小痘痘要先确定具体病因，然后根据病因选择合适的治疗方法，同时要注意个人卫生和防止传染。