前列腺囊肿的引起原因主要有以下几方面。首先是先天性因素，在胚胎发育时期，中肾导管与中肾旁管发育异常，管腔部分扩张就可能形成前列腺囊肿，这种先天性的情况从胚胎阶段就已存在诱因。
先天性发育异常导致
苗勒管退化不全： 在男性胎儿发育过程中，苗勒管如果退化不全，就可能引发前列腺囊肿相关的发育异常情况。这是因为苗勒管的正常退化对于前列腺的正常形态和结构形成至关重要，退化不全就会使局部组织异常增生扩张形成囊肿。中肾导管异常： 中肾导管的异常发育也是导致先天性前列腺囊肿的一个因素。中肾导管在胚胎时期有其特定的发育路径和功能，若出现异常，就可能导致管腔扩张，进而形成囊肿结构。
后天性因素影响
炎症性因素： 前列腺的慢性炎症会长期刺激前列腺组织，使得腺泡发生梗阻，分泌物逐渐潴留，从而形成囊肿。例如慢性前列腺炎患者，如果炎症没有得到有效控制，长期的炎症刺激就可能引发这种情况。一般来说，慢性炎症的长期存在是一个较为关键的时间因素，炎症持续的时间越长，发生前列腺囊肿的可能性相对越高。寄生虫性因素： 某些寄生虫感染也可能引起前列腺囊肿。比如寄生虫会导致前列腺管及周围发生慢性炎症，或者引起结缔组织增生，最终形成囊肿。像棘球蚴寄生在前列腺部位，就可能逐步引发前列腺组织的病变，导致囊肿形成。
其他因素相关
退行性变因素： 随着年龄的增长，前列腺腺泡会发生退行性改变，这种退行性变可能导致囊肿形成。年龄因素是一个不可忽视的点，随着男性年龄的增加，前列腺组织的退行性变化是一种自然的生理过程，但部分人可能会因为这种退行性变出现前列腺囊肿。一般男性到一定年龄后，前列腺的退行性改变概率会增加，进而增加了患前列腺囊肿的风险。