怀孕初期小腹两侧隐隐作痛可能是生理现象，也可能是先兆流产、宫外孕等情况，对应的处理方式包括观察、药物治疗、手术治疗等以保胎或终止妊娠。
一、生理现象：孕期孕妇荷尔蒙分泌增多，会致使盆腔有轻度充血，从而出现小腹隐隐作痛。有些患者对此较为敏感，当受精卵着床时，子宫会增大，韧带受到牵扯时也会产生轻微疼痛，这属于常见的生理表现。
二、先兆流产：若孕妇小腹两侧疼痛且伴有阴道流血，通常是由子宫收缩导致。孕妇要及时前往医院抽血检测HCG，并结合B超来明确诊断。一旦确诊为先兆流产，孕妇需卧床休息，可在医生指导下口服地屈孕酮片、保胎灵胶囊等药物进行医治。
三、宫外孕：受精卵未在子宫内着床而出现宫外孕，随着受精卵增大，会导致着床部位破裂，进而引发腹痛、阴道出血。所以在怀孕初期若有小腹疼痛，必须警惕宫外孕。若发现是宫外孕，应即刻进行手术，以防出现严重出血。
总之，怀孕初期出现小腹两侧隐隐作痛的情况，要根据具体表现和检查结果来明确原因，并采取相应的措施。如果有异常情况，应及时就医。