再生障碍性贫血的原因目前尚未完全明确，但已知有多种因素可能导致。据研究，大约50% - 70%的再生障碍性贫血与化学因素有关。
化学因素方面
药物因素：某些药物可能引发再生障碍性贫血，像氯霉素，它在临床应用中被发现可能会对骨髓造血功能产生抑制作用，从而增加患再生障碍性贫血的风险。还有抗肿瘤的化疗药物，如烷化剂类药物，它们在杀灭肿瘤细胞的同时，也可能损害骨髓造血干细胞，导致再生障碍性贫血的发生。化学毒物因素：长期接触苯及其衍生物等化学毒物也容易诱发再生障碍性贫血。例如，在一些橡胶厂、油漆厂工作的人员，长期处于苯接触环境中，患再生障碍性贫血的几率会明显高于普通人。
物理因素方面
辐射因素：长期接触大剂量的电离辐射，如X射线、γ射线等，会对人体骨髓造血干细胞造成损伤。比如，在接受放疗的肿瘤患者，如果辐射剂量控制不当，就可能出现骨髓抑制，进而引发再生障碍性贫血。一般来说，当人体受到高于一定剂量的电离辐射时，就可能影响骨髓的正常造血功能。
生物因素方面
病毒感染因素：某些病毒感染可能与再生障碍性贫血的发生有关。例如，肝炎病毒，尤其是丙型肝炎病毒，感染后可能会导致免疫系统攻击骨髓造血干细胞，引起造血功能障碍。还有人类微小病毒B19感染，也被发现与再生障碍性贫血的发病存在一定关联。病毒感染后可能通过直接损伤造血干细胞或引发免疫异常来导致再生障碍性贫血。