舌头两侧起泡还疼痛的原因主要有局部原因和全身原因这两大类，需区别对待处理。
一、局部原因
1.口腔局部出现炎症：若患者口腔卫生不佳会引发口腔局部炎症，表现为舌乳头变大类似水泡。这种情况可通过含漱漱口水来缓解，要是局部疼痛明显或有特定疼痛状况，可喷西瓜霜或使用口腔贴片，平时要注重口腔卫生，做到勤刷牙、勤漱口。
2.局部刺激：舌黏膜上皮较为薄弱，在遭受机械刺激或温度刺激时容易使黏膜上皮发生变性，进而导致水泡出现。可遵医嘱口服头孢类消炎药，如头孢丙烯胶囊或头孢地尼分散片等，同时使用康复新液含漱。口腔内的牙尖、不良修复体、残根残冠，或是咬破舌头或黏膜形成血泡，在患者说话或咀嚼食物时舌头与牙齿发生碰撞刺激，从而引起炎症和起泡现象，可到专业的牙科门诊将尖锐部分打磨光滑以减少此类情况发生。
二、全身原因
1.上火导致口腔溃疡：可能是胃火旺盛、心火旺盛等所致，这种情况下应口服清热解毒的药物来缓解症状，避免进食辛辣刺激性、过烫过硬的食物，期间要多喝水，还可煮些绿豆汤来帮助降火。
2.体内缺乏微量元素及维生素：多食用富含维生素的水果和蔬菜，补充维生素B2，可助力口腔黏膜快速修复。
3.免疫系统疾病：疱疹病毒感染，当患者身体抵抗力低下或因感冒致使口腔受疱疹病毒感染，会表现为口腔黏膜出现针尖状呈簇状的水泡，泡壁较薄，破溃后呈小的溃疡面并伴有疼痛感。这种情况下应尽量多休息，改变不良生活习惯，保证良好作息以提高自身免疫力。
总之，对于因上述各种病因引起的水泡，建议患者到医院检查确诊后对症进行处理。治疗期间要多喝水、多休息，放松心情，保证充足睡眠，注意口腔卫生以避免细菌感染。