食管乳头状瘤的治疗主要以手术切除为主，一般通过内镜下切除即可，多数患者经一次手术就能解决问题。
手术治疗方式
内镜下切除术： 这是治疗食管乳头状瘤的主要方法。医生会通过内镜将病变部位切除，创伤比较小。比如直径较小的食管乳头状瘤，通常可以在内镜下完整切除。手术时机选择： 一旦确诊为食管乳头状瘤，就建议尽早进行手术切除，尤其是当瘤体有增大趋势或者出现一些可疑症状时。
术后注意事项
饮食方面： 术后短期内要吃清淡、易消化的食物，像米粥、面条等。一般术后1 - 2天可以先吃流食，然后逐渐过渡到半流食、正常饮食。避免吃辛辣、刺激性强的食物，比如辣椒、浓茶、咖啡等，这些食物可能会刺激食管，影响恢复。复查安排： 术后需要定期复查内镜，一般建议术后1个月、3个月、6个月分别复查一次内镜，观察食管恢复情况以及有无复发等。
与其他疾病的鉴别
与食管息肉鉴别： 食管息肉一般外观多为球形或分叶状，有蒂或无蒂，而食管乳头状瘤通常呈乳头状或桑葚状。通过内镜下观察形态以及病理检查可以明确鉴别。与食管鳞状细胞癌鉴别： 食管鳞状细胞癌病理上癌细胞有异型性，生长方式呈浸润性等特点，而食管乳头状瘤病理表现为乳头中心为血管结缔组织，被覆增生的鳞状上皮，可通过病理活检准确鉴别。