脸上长扁平疣主要是由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的，尤其是HPV - 3型等亚型病毒。大约65%的扁平疣患者在发病后2 - 3年可自行消退，但也有部分人会持续存在或复发。
病毒感染途径
直接接触传染： 比如与扁平疣患者直接接触，就有可能被传染。比如和患者握手、共用毛巾等，病毒可通过皮肤的微小破损进入细胞内并复制、增殖，从而引发扁平疣。间接接触传染： 通过接触被患者污染的物品也能感染。像在公共浴室、游泳池等场所，接触了被患者污染的毛巾、拖鞋等，也有感染HPV的风险。
自身因素影响
免疫力低下： 当人体免疫力较低时，更容易受到HPV的侵袭。比如长期熬夜、过度劳累、患有某些慢性疾病（如糖尿病等）的人，身体的免疫防御功能减弱，就比较容易长扁平疣。例如，长期熬夜的人，身体的各项机能处于紊乱状态，免疫系统功能下降，感染HPV长扁平疣的几率就会增加。皮肤屏障功能受损： 皮肤是人体抵御外界病菌的第一道防线，如果皮肤出现破损，如搔抓、外伤等，就会使皮肤的屏障功能受损，HPV更容易侵入。比如皮肤被划伤后没有及时处理，此时接触到HPV就容易感染长扁平疣。
易发人群特点
青少年群体： 青少年的免疫系统还在发育阶段，相对比较脆弱，更容易感染HPV。据统计，16 - 30岁的青少年和年轻人群体中，扁平疣的发病率相对较高。这是因为这个年龄段的人群皮肤代谢活跃，而且生活中可能更容易接触到HPV，同时自身免疫力相对成年人来说稍低一些。皮肤易受损人群： 比如经常从事体力劳动，手部皮肤容易有破损的人，或者是喜欢搔抓皮肤的人，这类人群皮肤屏障容易受损，感染HPV长扁平疣的可能性更大。例如，建筑工人由于手部经常接触各种物质且容易受伤，比一般人患扁平疣的几率要高一些。