脸上扁平疣主要是由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的，尤其是HPV - 3型、HPV - 5型等亚型。据统计，约65%的扁平疣患者是通过直接接触感染源而发病的。
病毒感染途径
直接接触传播： 比如与扁平疣患者共用毛巾、脸盆等个人物品，就有可能被传染。如果皮肤有微小破损，感染风险会更高。例如，在学校宿舍、家庭中，如果有人患有扁平疣，其他人接触到被污染的物品后就容易被感染。自身接种传播： 患者自身搔抓患处，病毒会随着搔抓接种到身体其他部位，从而导致新的疣体出现。比如脸上有一个扁平疣，患者用手搔抓后，病毒可能会传播到脸部其他部位或者身体其他部位，引发更多的扁平疣。
皮肤状态影响
免疫力低下人群： 当人体免疫力下降时，比如长期熬夜、过度劳累、患有慢性疾病等情况，身体对HPV的抵御能力减弱，就更容易感染扁平疣。像一些经常加班熬夜的上班族，或者患有糖尿病等慢性疾病的人，相对来说更容易长扁平疣。皮肤屏障功能受损： 皮肤受到外伤、晒伤等，会使皮肤的屏障功能受损，这时候HPV就更容易侵入皮肤细胞。例如，皮肤被晒伤后，皮肤的防御能力降低，此时接触到HPV就容易感染引发扁平疣。
环境因素相关
公共环境接触： 在公共浴室、游泳池等公共场合，如果卫生条件不佳，存在HPV病毒，也可能感染扁平疣。因为这些公共环境中HPV病毒可能会存活一定时间，接触后就有感染风险。比如在卫生状况差的公共游泳池游泳，就有可能接触到HPV而患上扁平疣。