甲状腺结节的治疗方法需根据结节性质等因素决定，对于良性甲状腺结节，若结节较小且无明显症状，一般定期观察即可，每3~6个月复查超声；若结节较大（直径≥4cm）压迫周围组织，可考虑手术治疗。
观察随访为主的情况
无症状良性小结节： 当甲状腺结节为良性且患者无任何不适症状，结节直径小于1cm时，通常建议每3~6个月进行甲状腺超声检查，观察结节大小、形态等变化。比如一些体积很小的良性结节，在长时间内可能不会有明显变化。良性结节但有特定情况： 如果是良性结节，但合并甲状腺功能亢进，且通过药物治疗后甲状腺功能控制稳定，结节也可先观察，定期复查超声和甲状腺功能。
手术治疗的情况
结节较大有压迫症状： 当甲状腺结节直径大于4cm，压迫气管、食管等，出现呼吸困难、吞咽困难等症状时，多需要手术切除。例如结节压迫气管导致患者呼吸不畅，影响正常生活，手术是较好的解决方式。怀疑恶性的结节： 若超声等检查怀疑甲状腺结节为恶性，如结节形态不规则、边界不清、有微钙化等情况，通常需要手术切除，进一步做病理检查明确性质。
药物辅助治疗情况
伴甲状腺功能异常时用药： 若甲状腺结节伴甲状腺功能减退，可服用左甲状腺素钠片进行替代治疗，维持甲状腺功能正常；若伴甲状腺功能亢进，可根据情况使用抗甲状腺药物，如甲巯咪唑等，但药物治疗一般是辅助控制甲状腺功能，不能使结节消失。比如甲状腺结节伴甲减患者，需要长期服用左甲状腺素钠片，并定期监测甲状腺功能调整剂量。