肛瘘合并肛裂的治疗方式需依具体情况而定，并无所谓的最佳方式。以下是具体阐述：
一、肛瘘的治疗
1.手术治疗为主，常见术式有挂线疗法、肛瘘切开术、肛瘘切除术等。
(1)挂线疗法通过橡皮筋缓慢勒割瘘管，促进其逐渐愈合。
(2)肛瘘切开术直接将瘘管切开，使引流通畅。
(3)肛瘘切除术则是将瘘管及周围组织一并切除。
2.辅以药物治疗，术后要保持切口周围清洁，可温水坐浴及冲洗，同时通过静脉滴注抗生素预防感染，如注射用头孢唑林钠、盐酸左氧氟沙星注射液、盐酸克林霉素注射液等。
二、肛裂的治疗
1.对于病程短、病情轻的新发肛裂患者：
(1)可在医生指导下口服缓泻剂，如麻仁丸、蓖麻油、肠舒胶囊、乳果糖口服溶液等。
(2)调整饮食结构，避免辛辣刺激性食物，多吃软质易消化且富含纤维的食物，多吃新鲜蔬菜水果，多喝水。
2.症状稍重的肛裂患者：
(1)除调整饮食和口服缓泻剂外，还可考虑高锰酸钾溶液温水坐浴或用复方荆芥熏洗剂熏蒸。
(2)使用硝酸甘油软膏、痔疮膏外涂。
3.病情症状较重者需手术治疗，术式包括肛裂切除术、内括约肌切断术、皮瓣移植术等。
总之，肛瘘合并肛裂的治疗要根据患者具体病情选择合适的方法，综合运用手术和药物等手段，以达到较好的治疗效果。