吃紧急避孕药可能会带来一些危害。一般来说，紧急避孕药一个月经周期内仅能服用一次，一年内最好不超过3次。
月经紊乱方面
经期改变： 服用紧急避孕药后，约有10%的女性可能出现经期提前或推迟的情况。比如本应28天左右来一次月经，可能会提前3 - 7天或者推迟相同时间。经量变化： 部分女性服用后经量会减少，还有些人经量会增多，甚至可能出现不规则阴道出血的情况。
肠胃不适方面
恶心呕吐： 大约有50%的人在服用紧急避孕药后会出现恶心症状，其中约20%的人会伴随呕吐。一般在服药后的1 - 2天内出现这种情况，症状较轻的可能持续1 - 2天就缓解，严重的可能会影响进食。头晕乏力： 服用后约有20%的人会感觉头晕，同时伴有乏力的症状，这种情况一般会持续数小时，不过也有少数人会持续1 - 2天。
对内分泌的影响方面
激素水平波动： 紧急避孕药含有较高剂量的孕激素，会影响体内正常的激素平衡。通常在服用后的1 - 2周内，体内的雌激素、孕激素水平会出现波动。比如雌激素水平可能会先短暂升高，然后迅速下降，这种波动可能会对内分泌系统产生持续约1 - 3个月的影响，进而影响到身体的多个生理功能。