尿道炎主要是由病原体感染引起的，常见的病原体有大肠杆菌等，大约50%的尿道炎是由大肠杆菌导致的。
病原体感染途径
尿道直接感染： 外界病菌可直接侵入尿道，比如留置导尿管时，细菌就容易顺着尿管进入尿道引发感染。上行感染： 最为常见，像大肠杆菌等致病菌可从尿道口上行，经过尿道进入膀胱甚至肾脏。比如女性尿道短而宽，细菌更容易上行感染引发尿道炎。血行感染： 身体其他部位的感染病灶，病菌可通过血液循环到达尿道引发炎症。不过这种情况相对较少见。
个人卫生因素影响
不注意清洁： 不经常清洗外阴和尿道口，会导致细菌滋生，增加尿道炎的发病风险。尤其是女性，每天应至少清洗外阴一次，保持局部清洁。不洁性生活： 性生活时不注意卫生，容易将外界病菌带入尿道，引发感染。例如，男性包皮过长，若不注意清洁，性生活时也容易把病菌传染给女方，同时自身也易感染尿道炎。
局部抵抗力下降
机体免疫力低： 当人体免疫力下降时，比如患有糖尿病、长期使用免疫抑制剂等情况，身体对病菌的抵御能力减弱，容易发生尿道炎。糖尿病患者血糖高，有利于细菌生长繁殖，更容易出现尿道感染。局部损伤： 尿道受到损伤，如尿道器械检查、性生活过于剧烈等导致尿道黏膜损伤，就为病菌入侵创造了条件，从而引发尿道炎。进行尿道器械检查后，要注意预防感染，避免细菌趁损伤部位侵入。