治疗鼻窦炎的药物有多种，常用的有抗生素类、鼻用糖皮质激素、黏液促排剂等。比如急性细菌性鼻窦炎可能会用到抗生素，一般疗程可能在10天左右。
抗生素类药物
青霉素类： 如阿莫西林，适用于革兰阳性球菌等引起的鼻窦炎，但对青霉素过敏者禁用。头孢菌素类： 像头孢克洛，对多种细菌有抗菌作用，不过使用前需确认患者是否有头孢类药物过敏史。
鼻用糖皮质激素
糠酸莫米松鼻喷雾剂： 能减轻鼻黏膜炎症反应，缓解鼻塞、流涕等症状，但孕妇及哺乳期妇女需在医生指导下使用，使用时要注意正确的喷鼻方法。布地奈德鼻喷雾剂： 可有效改善鼻窦的炎症环境，儿童使用时需谨慎，要遵循医生建议的剂量和使用方法。
黏液促排剂
桉柠蒎肠溶软胶囊： 可以促进鼻腔和鼻窦内黏液排出，稀释黏液，帮助改善鼻窦的通气引流。一般成人服用剂量有规定，但儿童使用时要根据年龄调整剂量。标准桃金娘油肠溶胶囊： 同样能调节黏液分泌，促进纤毛运动，利于鼻窦分泌物排出，用药时要注意温水送服，避免破坏药物结构。
减充血剂
麻黄碱滴鼻液： 能收缩鼻黏膜血管，减轻鼻塞症状，但连续使用一般不宜超过7天，长期使用可能会引起药物性鼻炎。赛洛唑啉滴鼻液： 也可缓解鼻塞，但儿童使用浓度需适当调整，高血压、冠心病等患者要慎用。