药流流不干净可能会有以下后果：
1.持续出血：药流后如果子宫内有残留组织，可能会导致持续出血，出血时间可能会超过两周，甚至更长。这可能会引起贫血等健康问题。
2.感染：药流后如果子宫内有残留组织，容易引发感染。可能会出现发热、腹痛、分泌物异味等症状。严重的感染可能会导致盆腔炎、腹膜炎等并发症。
3.月经不调：药流可能会影响卵巢功能，导致月经不调。可能会出现月经周期缩短或延长、月经量增多或减少等问题。
4.残留组织机化：如果药流后残留组织没有及时排出，可能会机化，形成息肉、粘连等。这可能会影响子宫的正常功能，导致不孕症等问题。
如果药流后出现持续出血、发热、腹痛等异常症状，应及时就医，进行B超等检查，以确定是否药流干净。如果药流不干净，医生可能会建议进行清宫手术等进一步治疗。
需要注意的是，药流有一定的失败率和风险，建议在医生的指导下进行药流，并严格遵守注意事项。如果对药流有任何疑问或担忧，应及时与医生沟通。