药流流不干净可能会有以下后果：
1.持续出血：药流后，如果子宫内有残留的组织，可能会导致持续的阴道出血。出血时间可能会较长，甚至超过正常的月经周期，这可能会引起贫血和感染等问题。
2.感染：药流后，子宫颈口处于开放状态，容易受到细菌感染。如果药流不干净，残留的组织会成为细菌滋生的温床，导致子宫内膜炎、盆腔炎等感染性疾病。
3.不完全流产：药流不干净可能导致部分胚胎组织仍然残留在子宫内，这被称为不完全流产。不完全流产可能会影响子宫的正常收缩，导致持续的腹痛和出血，还可能引发长期的月经不调、习惯性流产或不孕症等问题。
4.子宫内膜异位症：药流过程中，子宫内膜可能会被逆流到腹腔，种植在其他部位，导致子宫内膜异位症。这可能会引起痛经、性交疼痛等症状，并增加不孕症的风险。
如果药流后出现持续出血、腹痛、发热等异常症状，应及时就医进行检查。医生通常会通过B超等检查手段确定药流是否干净，并根据具体情况采取相应的治疗措施，如清宫手术、药物治疗或进一步的观察等。
在进行药流前，应遵循医生的建议，进行全面的身体检查，并在药流后注意休息和护理，避免过度劳累和性生活。如果对药流过程或结果有任何疑问，应及时与医生沟通。此外，药流并不是适用于所有人的，某些情况下，如怀孕时间过长、有药流禁忌证等，可能需要选择其他的终止妊娠方法。因此，在考虑药流时，应在医生的指导下做出决策，并严格按照医生的建议进行操作。