智齿萌出时疼痛通常是因为并发了智齿冠周炎。需进行冠周冲洗、上药等处理，严重时还需手术。具体如下：
一、原因：
1.智齿冠周炎是常见口腔感染性疾病，牙冠可能完全被牙龈瓣覆盖，进食时食物残渣易进入牙龈瓣内。
2.若不注重口腔卫生，会导致牙龈瓣内牙菌斑聚集，进而引发智齿冠周炎。
3.患者会有磨牙后区胀痛不适，咀嚼、吞咽或张口时疼痛加重，严重者会张口受限、牙关紧闭，可能伴有全身症状如发热、头痛、食欲减退等。
二、治疗：
1.局部处理是主要方法，使用过氧化氢溶液、醋酸氯己定溶液反复冲洗龈袋，直到溢出液清亮。
2.冲洗后将碘甘油或碘酊放入龈袋内。
3.必要时遵医嘱使用抗菌消炎药物，如阿莫西林胶囊。
4.若已形成龈瓣附近脓肿，需切开排脓引流以防止炎症扩散。
总之，智齿疼痛多因智齿冠周炎，应根据具体情况采取相应治疗措施以缓解疼痛和控制病情。