阴茎上长水疱可能是由生殖器感染、生殖器部位皮肤过敏等原因引起，需要依据不同病因和病情发展程度采取相应治疗措施。
一、生殖器感染：
1.病毒感染：
若阴茎上长水疱是生殖器疱疹导致，这是由单纯疱疹病毒引起的性传播疾病。当疱疹未破溃且患者有瘙痒感时，可局部用炉甘石洗剂涂抹止痒；若疱疹疼痛明显，可口服镇痛药，如吲哚美辛片、布洛芬缓释胶囊、加巴喷丁胶囊等。同时，需进行抗病毒治疗，可遵医嘱口服阿昔洛韦胶囊、泛昔洛韦胶囊、盐酸伐昔洛韦胶囊等，皮损处可使用阿昔洛韦乳膏涂抹。
2.细菌感染：
发生细菌感染时也会使阴茎上长水疱，还会伴有疼痛、红肿等症状。针对细菌感染，一般可外用莫匹罗星软膏、红霉素软膏等。
3.霉菌感染：
霉菌感染严重时会出现阴茎长水疱现象，可能还伴有尿频、尿急、尿痛以及尿道口有分泌物等情况。对于霉菌性感染，通常建议使用硝酸咪康唑乳膏或克霉唑乳膏等药物。
二、生殖器部位皮肤过敏：
生殖器部位皮肤过敏可能引发阴茎上长水疱，常伴有红肿、疼痛等症状。可遵医嘱口服抗过敏药物，如氯雷他定片、盐酸西替利嗪片等，局部可用激素类药膏治疗过敏性皮肤感染，如复方醋酸地塞米松乳膏、丁酸氢化可的松乳膏等。
总之，阴茎上长水疱的原因多样，需要及时就医进行相关检查以明确病因，然后进行针对性治疗。日常生活中要注意清洁卫生，避免食用辛辣刺激性食物。治疗期间应避免性生活，接触过的衣物、被褥、毛巾、敷料等要及时消毒，且不要与健康人群共用。