扁平尤是由人类乳头瘤病毒（HPV）感染引起的良性赘生物，治疗方法有多种。一般来说，可采用药物治疗、物理治疗等方式。比如药物治疗中常用的有维A酸类药物等，但具体治疗需根据个体情况选择。
药物治疗方面
外用药物： 可以使用维A酸乳膏，它能调节表皮细胞的分化和增殖，起到一定的治疗扁平尤作用。还有5%氟尿嘧啶软膏，不过使用时要注意避免接触正常皮肤。免疫调节剂： 像卡介菌多糖核酸注射液，它可以调节机体免疫功能，有助于扁平尤的恢复，但使用要在医生指导下进行。
物理治疗方式
冷冻治疗： 是利用低温使扁平尤组织坏死脱落。一般来说，治疗后局部会有红肿，可能在1 - 2周内结痂脱落。不过冷冻治疗可能会有疼痛等不适，对于较大的扁平尤可能需要多次治疗。激光治疗： 利用激光的能量破坏扁平尤组织。治疗后局部会有创面，要注意保持创面清洁，避免感染，通常创面会在1 - 2周内愈合。
日常注意事项
避免搔抓： 扁平尤患者要尽量避免搔抓患处，因为搔抓可能会导致病毒接种到其他部位，引起新的扁平尤生长。注意个人卫生： 要保持皮肤清洁，勤换衣物，不和他人共用毛巾等个人物品，防止交叉感染。增强免疫力： 平时要注意合理饮食，保证充足睡眠，适当进行体育锻炼，以增强身体免疫力，有利于扁平尤的恢复和预防复发。例如每天进行30分钟左右的有氧运动，如快走、慢跑等。