产后三个月小肚子隐隐作痛可能有以下几种情况：一是可能为快来月经的表现；二是可能是盆腔炎；三是可能是急性胃肠炎。
一、如果产后三个月一直未恢复月经，此时出现小肚子隐隐作痛，很可能是即将来月经的迹象。因为多数女性在产后2至3个月会迎来月经复潮，部分女性由于自身体质原因，在来月经前会有小肚子隐痛的症状。
二、若伴有阴道分泌物增多、阴道异常流血等情况，且在性交或活动后疼痛加剧，那么则考虑是盆腔炎。可在医生指导下使用抗生素类药物进行治疗，如头孢、阿莫西林等。
三、要是同时伴有腹泻、恶心、呕吐等表现，还可能是出现了急性胃肠炎，其诱发原因可能是腹部着凉，或是进食了不洁、变质的食物，也可能是感染了肠道病毒，比如轮状病毒、诺如病毒等。此时可前往医院进行大便常规检查，依据检查结果进行对症治疗。若存在细菌感染，可使用诺氟沙星、氧氟沙星等药物进行治疗。
总之，产后三个月小肚子隐痛的原因较多，需要结合具体症状和检查来明确诊断，并采取相应的治疗措施。