肚子两侧疼可能由多种原因引起。比如泌尿系统结石就比较常见，像输尿管结石，当结石在输尿管移动时，就可能导致肚子两侧（对应输尿管走行部位）疼痛，这种疼痛往往比较剧烈，呈绞痛样。
泌尿系统疾病导致
输尿管结石： 除了肚子两侧疼，还可能伴有血尿，一般是镜下血尿，也可能是肉眼可见的血尿。患者可能会出现恶心、呕吐等症状。如果结石较小，有可能自行排出，这时候要注意多喝水，每天饮水量最好能达到2000 - 3000毫升以上，促进结石排出；但如果结石较大，可能需要就医进行体外冲击波碎石等治疗。肾盂肾炎： 除了肚子两侧疼，还会有发热症状，体温可能会升高到38℃以上，同时伴有尿频、尿急、尿痛等膀胱刺激症状。患者需要及时就医，一般会使用抗生素治疗，如头孢类抗生素等，但具体用药需遵医嘱。
肠道疾病导致
结肠炎： 慢性结肠炎患者肚子两侧疼可能是隐痛或胀痛，还可能伴有腹泻，大便次数增多，可能是每天3 - 5次不等，大便质地较稀，可能含有黏液。患者在饮食上要注意避免吃辛辣、油腻、刺激性食物，如辣椒、油炸食品等，以免加重肠道负担。肠道痉挛： 可能是由于腹部着凉、进食生冷食物等引起，肚子两侧会突然出现阵发性疼痛，疼痛程度不一，有的较轻，有的较剧烈。可以通过局部热敷来缓解，用温热的毛巾敷在疼痛部位，每次热敷15 - 20分钟左右，能起到一定的缓解作用。
妇科疾病导致（女性）
附件炎： 除了肚子两侧疼，还可能伴有白带增多，白带颜色、质地可能发生改变，如变黄、变稠等。患者可能会有腰骶部酸痛的感觉，在月经期、劳累后症状可能会加重。治疗上一般需要使用抗生素，如甲硝唑等，但要在医生指导下使用。卵巢囊肿蒂扭转： 这种情况比较危急，肚子两侧会突然出现剧烈疼痛，往往是一侧更明显，同时可能伴有恶心、呕吐等症状。一旦怀疑有卵巢囊肿蒂扭转，需要立即就医，可能需要进行手术治疗来复位囊肿或切除囊肿。