怀葡萄胎的原因目前尚不十分明确，一般认为可能与营养因素、染色体异常、内分泌失调等有关。其中，营养因素中，饮食中缺乏维生素A及其前体胡萝卜素和动物脂肪者，发生葡萄胎的几率明显增高。
营养因素
维生素缺乏： 研究发现，饮食中缺乏维生素A及其前体胡萝卜素和动物脂肪是发生葡萄胎的高危因素。比如，长期素食且不注重补充富含维生素A食物的人群，相对更容易出现葡萄胎情况。微量元素缺乏： 像饮食中缺乏锌和硒等微量元素，也可能增加葡萄胎发生风险。
染色体异常
卵子染色体异常： 正常情况下，卵子携带的是单倍体染色体（23条）。如果卵子染色体异常，比如为空卵，即只有细胞核的外壳，没有染色体核，那么受精后就容易形成葡萄胎。精子染色体异常： 精子染色体异常也可能导致葡萄胎，比如精子染色体数目异常等情况，与卵子结合后发育成葡萄胎。
内分泌失调
孕激素不足： 女性体内孕激素对维持正常妊娠起着重要作用。当孕激素水平不足时，子宫蜕膜发育不良，影响胚胎正常发育，就可能引发葡萄胎。一般来说，妊娠早期孕激素水平过低，就可能增加葡萄胎发生几率。绒毛膜促性腺激素（hCG）异常： 正常妊娠时，hCG会呈现特异性变化。而葡萄胎患者血和尿中的hCG浓度明显高于正常妊娠相应月份的值，且hCG持续处于高水平，这与葡萄胎组织异常增生、滋养细胞过度增殖有关，异常的hCG水平干扰了正常妊娠的生理过程，导致葡萄胎形成。