手指疣主要是由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的，尤其是HPV-1型等亚型。一般来说，当皮肤有破损，接触到HPV病毒后就容易被感染从而长出手指疣。
病毒传播途径
直接接触传播： 如果直接接触了已经长有疣的人，比如和长疣的人握手等，就有可能被传染上HPV病毒。尤其是皮肤有破损的时候，感染的风险会更高。间接接触传播： 接触被HPV污染的物品，像共用毛巾、拖鞋等，也可能感染手指疣。比如在公共浴室、游泳池等场所，接触了被病毒污染的物品，就有感染的可能。
自身因素影响
免疫力低下： 当人体的免疫力比较低的时候，比如长期熬夜、过度劳累、患有某些疾病导致免疫力下降等情况，身体抵御HPV病毒的能力变弱，就更容易感染手指疣。例如，艾滋病患者因为免疫系统严重受损，感染HPV长疣的几率就比正常人高很多。皮肤破损： 手指部位的皮肤如果有擦伤、划伤等破损情况，这时候HPV病毒就更容易侵入皮肤细胞，进而引发手指疣。比如做家务时手指被划伤，没有及时处理，就可能感染病毒长疣。
环境因素相关
潮湿环境： 手指长期处于潮湿的环境中，比如经常洗手后没有擦干，或者工作环境比较潮湿等，这样的环境有利于HPV病毒的存活和感染。因为潮湿的环境能为病毒提供相对适宜的生存条件，增加感染的可能性。公共场所频繁接触： 在一些公共场所，人员流动大，HPV病毒传播的机会增多。比如在健身房、学校等场所，接触公共设施后如果不注意手部清洁，就容易感染手指疣。