手上长跖疣主要是由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的，尤其是HPV-1型病毒居多。一般人体皮肤黏膜有破损时，接触到HPV就容易被感染从而长跖疣。
感染途径方面
直接接触感染： 比如直接接触了患有跖疣人群的患处，就有可能被传染。如果经常在公共浴池、游泳池等公共场所赤脚行走，接触到被HPV污染的地面等，也增加了感染风险。间接接触感染： 使用了被HPV污染的物品，像共用毛巾、拖鞋等，也可能引发感染。比如在公共浴室共用没有消毒的拖鞋，就可能感染上导致跖疣的病毒。
自身因素影响
皮肤破损： 当手部皮肤有细微破损时，比如被指甲划伤、摩擦破损等，这时候HPV就更容易侵入皮肤细胞，进而引发感染长跖疣。一般皮肤越薄嫩、破损越明显，感染几率相对越高。免疫力低下： 当人体免疫力比较低的时候，比如长期熬夜、过度劳累、患有某些基础疾病导致免疫力下降等情况，身体对HPV的抵御能力减弱，就更容易感染长跖疣。比如长期熬夜的人，免疫力下降，比作息规律的人更易长跖疣。
环境因素作用
潮湿环境： 手部长期处于潮湿的环境中，比如经常接触水且不能及时擦干，这样的环境有利于HPV的存活和感染。像经常洗碗、洗菜后手部长时间潮湿的人，长跖疣的可能性相对会高一些。温热环境： 手部处于温热的环境时，也为HPV的繁殖提供了一定条件。比如在炎热的天气里，手部皮肤温度相对较高，适合病毒的生长和感染。