紧急避孕药是无保护性生活后的补救措施，一般在同房后72小时内服用有效，但它可能带来一些危害。比如，约有10%的人服用后会出现月经紊乱，像月经提前或推迟1周以上比较常见。
导致月经紊乱
月经提前： 服用紧急避孕药后，体内激素水平骤变，可能会使子宫内膜提前脱落，从而出现月经提前的情况，有的女性月经会比正常周期提前3 - 5天甚至更久。月经推迟： 激素的波动也可能抑制排卵，影响正常的月经周期，导致月经推迟，若推迟超过10天，就需要排查是否怀孕或者因药物影响导致月经失调。
引起肠胃不适
恶心呕吐： 约有一部分人服用紧急避孕药后会出现恶心症状，严重的可能会呕吐，一般在服药后的几小时内出现，有的女性服药后1 - 2小时就会有恶心感觉，少数人呕吐反应比较强烈，可能需要就医处理。腹痛腹泻： 还有些人会出现腹痛、腹泻的情况，这是因为药物刺激胃肠道，导致肠胃蠕动加快，一般症状相对较轻，持续1 - 2天可自行缓解，但也有个别人持续时间较长。
影响内分泌
激素失衡： 紧急避孕药含有较高剂量的孕激素，会干扰人体正常的内分泌功能，长期或频繁服用可能使体内雌激素和孕激素的平衡被打破，影响卵巢的正常功能。比如，可能导致卵巢分泌激素的节律改变，影响卵泡的正常发育。影响排卵功能： 频繁使用紧急避孕药会对排卵产生抑制作用，打乱正常的排卵周期，长期下来可能会影响未来的生育能力，虽然不是绝对会导致不孕，但会增加受孕难度。
其他可能影响
乳房胀痛： 部分女性服用紧急避孕药后会出现乳房胀痛的情况，这是因为药物影响了体内激素水平，导致乳腺组织受到刺激，一般胀痛程度因人而异，有的女性胀痛较轻，持续几天就会缓解，有的则相对明显。头晕乏力： 少数人服药后会有头晕、乏力的感觉，这是药物的副作用之一，一般休息后可逐渐缓解，但在服药后的一段时间内可能会影响正常的活动和工作状态。