脑梗塞一般建议优先选择磁共振检查，不过在某些紧急情况下，也会先做CT初步筛查。磁共振成像（MRI）对于脑梗塞的早期诊断更敏感，能在发病几小时内就发现病灶，尤其是对于后颅窝等CT容易受骨伪影干扰的部位，MRI优势更明显。而CT在发病早期可能仅能发现一些明显的低密度梗死灶，一般在发病24-48小时后可能更清晰显示，但对于早期脑梗塞的检出率不如MRI高。
CT检查的特点
优势方面： CT检查速度快，能在几分钟内完成扫描，对于急诊患者可以快速排查是否有脑出血等类似脑梗塞症状的疾病。而且CT费用相对较低，一般几百元左右。局限性： CT对早期脑梗塞（发病6小时内）的敏感性较差，可能无法及时发现病灶。另外，对于脑干、小脑等部位的脑梗塞，CT受颅骨伪影影响，有时成像效果不佳。
磁共振检查的特点
优势方面： 磁共振可以多方位、多序列成像，能更早发现脑梗塞病灶，一般发病后1-2小时就能检测到缺血改变。它对脑梗塞的诊断准确率更高，尤其是能清晰显示小病灶以及后颅窝的病变。局限性： 磁共振检查时间相对较长，可能需要10-30分钟不等。而且体内有金属植入物（如心脏起搏器、金属假牙等）的患者不能做磁共振检查。另外，磁共振费用相对CT要高一些，一般在几百到上千元不等。
如何选择检查
如果患者是急性起病，有疑似脑梗塞症状，且没有磁共振检查禁忌证，优先选择磁共振检查。但如果患者情况紧急，无法马上做磁共振，或者有磁共振检查禁忌，那可以先做CT初步排查。比如一位突发口角歪斜、肢体无力的患者，医生会先问患者有无磁共振禁忌，如果没有，就会建议做磁共振来更精准地诊断脑梗塞；而如果患者有心脏起搏器不能做磁共振，那就先做CT看看大致情况。