脑梗患者一般优先选择CT检查，因为CT扫描速度快，通常在几分钟内就能完成，能快速发现脑梗早期的一些情况，比如是否有脑出血等情况与脑梗进行鉴别，一般费用相对磁共振低一些。但如果想更清晰地看到脑部血管及细微的脑组织病变，磁共振成像（MRI）更有优势，它可以更早发现脑梗病灶，尤其是在脑梗发生后的24小时内，能发现一些CT不易察觉的病变。
CT检查的特点
CT检查优势： CT对于急性脑出血的诊断非常敏感，能在几秒钟内分辨出脑部的高密度出血灶，对于初步判断脑梗患者是否有出血性转化有重要作用。而且CT检查费用相对较低，一般在200 - 500元左右，检查时间短，能快速为急诊患者提供初步诊断信息。CT检查局限性： CT对脑梗灶的早期发现有一定局限，尤其是发病24小时内的小病灶，可能显示不清。另外，对于后颅窝等部位的病变，受颅骨伪影影响，CT的成像效果可能不如磁共振。
磁共振检查的特点
磁共振优势： 磁共振可以多方位、多序列成像，能更早发现脑梗病灶，尤其是在脑梗发生后的数小时内，就能检测到脑缺血区的信号改变。它对脑组织的分辨率高，能清晰显示脑部血管情况，对于发现脑部微小的梗死灶以及评估脑梗死的范围和严重程度更有优势。磁共振检查局限性： 磁共振检查时间相对较长，一般需要10 - 30分钟不等。而且磁共振机器对体内有金属植入物（如心脏起搏器、金属假牙等）的患者有禁忌，不能进行检查。另外，磁共振检查费用较高，一般在500 - 1000元甚至更高。
临床选择原则
医生会根据患者的具体情况来选择CT还是磁共振。如果患者发病急，需要快速排除脑出血，优先选择CT；如果患者病情适合，且需要更详细地了解脑部血管和脑组织的细微病变，会选择磁共振。比如对于怀疑脑梗但不能排除脑出血的患者，先做CT；而对于一些需要进一步明确脑梗灶细节、评估血管情况的患者，则会安排磁共振检查。